編輯丨王多魚
排版丨水成文
可轉座元件(Transposable element,TE)占據了近一半的基因組,并推動了發育創新,然而,長末端重復序列(Long Terminal Repeat,LTR) 是某些可轉座元件兩端的 DNA 重復序列,它們對元件的復制、整合和基因表達調控發揮著關鍵作用。然而,我們對于 LTR 沉默的機制仍不完全清楚。
2025 年 10 月 29 日,同濟大學高紹榮院士、高亞威教授、王譯萱教授,北京大學劉君教授團隊合作(朱學昊、常展赫、肖維德為論文共同第一作者),在Cell Stem Cell期刊發表了題:N6-methyladenosine on L1PA Governs the Trans-silencing of LTRs and Restrains totipotency in Na?ve Human Embryonic Stem Cells 的研究論文。
該研究揭示了 m6A 修飾通過 L1PA RNA 介導的跨層級轉錄調控網絡,調控 LTR 沉默,并限制人類胚胎干細胞全能性,闡明了 RNA 修飾與染色質重塑之間的分子連接機制。
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在這項最新研究中,研究團隊證實,METTL3缺陷可使 na?ve 人類胚胎干細胞(hESC)恢復到全能樣狀態,伴隨著 8-細胞相關基因、eRNA 和LTR(特別是 ERV1 和 ERVL-MaLR)的重新激活和染色質重置。
此外,靈長類特有的L1PA上的 m6A 修飾被發現是必不可少的。從機制上來說,L1PA 與 8-細胞相關的 LTR 和 eRNA 結合,并通過與染色質調控因子形成 RNA 支架復合物來調控染色質,其中 m6A 指導蛋白質的結合偏好。
在 na?ve 人類胚胎干細胞(hESC)中,L1PA 上的 m6A 抑制 EP300 與 ERV1 的結合,并增強 KAP1 與 ERVL-MaLR 的結合,從而限制 LTR 的活性。同時,m6A-L1PA 信號軸或 eRNA 上的 m6A 限制了 8-細胞增強子處 EP300/H3K27ac 的占有率。
該研究的核心發現:
METTL3 缺失可使 na?ve 人類胚胎干細胞(hESC)獲得全能性并激活 8-細胞轉錄組;
L1PA 上的 m6A 修飾的去除激活了 8-細胞 LTR,并誘導 na?ve hESC 進入 8-細胞樣狀態
m6A 調節 L1PA 支架復合物中 EP300 和 KAP1 的募集偏好;
L1PA 與 8-細胞 LTR 和 eRNA 位點結合,并通過 m6A 形成不同的染色質狀態。
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這項研究揭示了一種保守機制——人類和小鼠利用物種特異性的 LINE-1 亞家族的 m6A 修飾來調控 LTR 的活性,這突顯了轉座子在細胞命運轉變期間 RNA-染色質相互作用中的關鍵作用。
論文鏈接:
https://www.cell.com/cell-stem-cell/abstract/S1934-5909(25)00371-6
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