在我們腳下的黑暗世界里,生活著一群神秘的“地下居民”——它們從未見(jiàn)過(guò)陽(yáng)光,卻在永恒的黑暗中繁衍生息;它們呼吸著稀薄的空氣,卻依然活力充沛;它們用爪子日夜不停地挖掘,在堅(jiān)硬的土層中開(kāi)辟自己的家園,每天干勁滿滿。這些地下哺乳動(dòng)物究竟是如何能在這樣艱苦的條件下“安居樂(lè)業(yè)”?
最近,它們的生存奧秘,被中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所研究員胡義波與中國(guó)科學(xué)院院士魏輔文團(tuán)隊(duì)首次揭開(kāi)。通過(guò)對(duì)四種典型地下哺乳動(dòng)物的深入研究,他們發(fā)現(xiàn),這些看似毫不相關(guān)的動(dòng)物,竟然在基因?qū)用妗安恢\而合”地選擇了相同的生存策略。更令人驚訝的是,支撐它們地下生活的主要力量,來(lái)自于它們?cè)趦|萬(wàn)年進(jìn)化歷程中對(duì)自身基因的精妙改造。
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動(dòng)物園中的裸鼴鼠(圖片來(lái)源:維基百科)
Part.1
極限挑戰(zhàn):地下世界的殘酷考驗(yàn)
光線?一絲沒(méi)有,永恒的黑暗里,眼睛就當(dāng)擺設(shè)。
氧氣?只有地面的一半,二氧化碳濃度卻是高得驚人。
每天干什么?挖土——堅(jiān)硬的土壤要耗費(fèi)大量體力,還有各種病菌四處潛伏。
這,便是地下哺乳動(dòng)物面臨的日常。
對(duì)于大多數(shù)哺乳動(dòng)物來(lái)說(shuō),這樣的環(huán)境簡(jiǎn)直是噩夢(mèng)。但是,自然界中卻有一些“勇士”選擇了這種極端的生活方式。從生活在中國(guó)秦嶺山區(qū)的中華竹鼠,到分布在非洲的裸鼴鼠,再到棲息在中東地區(qū)的盲鼴鼠,以及生活在高加索地區(qū)的土黃鼴形田鼠,這些動(dòng)物雖然生活在不同的大陸,屬于不同的動(dòng)物家族,卻都不約而同地選擇了地下生活。
為了在這樣的環(huán)境中生存,它們演化出了許多“專(zhuān)屬裝備”。比如,它們的眼睛都變得很小,有些甚至完全退化——在永恒黑暗的地下世界,視覺(jué)確實(shí)沒(méi)什么用處;它們的耳朵也縮小了,這樣在狹窄的地下通道中行動(dòng)更加便利;相反,它們的四肢變得異常粗壯有力,牙齒也特別堅(jiān)硬,這些都是為了適應(yīng)長(zhǎng)期的挖掘工作。
可這些變化遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠,真正的生存密碼還藏在別的地方。
Part.2
進(jìn)化神工:基因密碼的驚人發(fā)現(xiàn)
為了知道這些外表相似的特征背后是否也存在相似的基因變化,研究團(tuán)隊(duì)首先對(duì)中華竹鼠進(jìn)行了全面的基因組測(cè)序——這就像是為它制作了一張?jiān)敿?xì)的“基因身份證”。
結(jié)果令人震驚。研究人員發(fā)現(xiàn),在中華竹鼠的基因組中,一個(gè)名為Hsp90的基因家族發(fā)生了顯著的擴(kuò)張。通常情況下,大多數(shù)哺乳動(dòng)物只有2-3個(gè)Hsp90基因拷貝,但中華竹鼠竟然擁有10個(gè)!
Hsp90是一種特殊的蛋白質(zhì)。它就像是細(xì)胞內(nèi)的“應(yīng)急救援隊(duì)”,當(dāng)細(xì)胞面臨缺氧等緊急情況時(shí),Hsp90就會(huì)出動(dòng),幫助細(xì)胞制造一氧化氮——擴(kuò)張血管、保護(hù)細(xì)胞,讓動(dòng)物在缺氧環(huán)境中依然能夠正常生存。
簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),中華竹鼠相當(dāng)于在自己的基因工具箱里多準(zhǔn)備了幾把“救命鑰匙”,應(yīng)對(duì)地下極端環(huán)境中的困難,就自然比別人更輕松。
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昆明動(dòng)物博物館的中華竹鼠標(biāo)本(圖片來(lái)源:維基百科)
Part.3
改造升級(jí):眼睛和牙齒的“重新設(shè)計(jì)”
穴居動(dòng)物不只是在基因中“加裝備”,還會(huì)“改舊件”。研究人員比較了中華竹鼠和普通實(shí)驗(yàn)室小鼠在眼部、眼周和牙周組織中的基因表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)了更有趣的變化。
在眼部組織的分析中,中華竹鼠并沒(méi)有完全“關(guān)閉”視覺(jué)相關(guān)的基因,而是對(duì)它們進(jìn)行了精細(xì)的調(diào)節(jié)。一些負(fù)責(zé)維護(hù)眼部細(xì)胞的基因表達(dá)增強(qiáng)了,而另一些則被削弱了。這說(shuō)明,中華竹鼠的視覺(jué)系統(tǒng)并沒(méi)有完全報(bào)廢,而是經(jīng)過(guò)了“重新裝修”,以適應(yīng)地下的光照條件。
在牙齒方面,變化更加明顯。研究人員發(fā)現(xiàn),許多控制牙齒發(fā)育的關(guān)鍵基因都發(fā)生了表達(dá)變化。特別是一些通常會(huì)限制牙齒生長(zhǎng)的“剎車(chē)基因”被削弱了,這可能有助于中華竹鼠長(zhǎng)出更加堅(jiān)硬、更適合挖掘的牙齒。
這些發(fā)現(xiàn)告訴我們,地下哺乳動(dòng)物并不是簡(jiǎn)單地“關(guān)閉”某些功能,而是像一個(gè)精明的工程師一樣,對(duì)自己的“身體機(jī)器”進(jìn)行了全面的改造升級(jí)。
Part.4
殊途同歸:四兄弟的驚人默契
當(dāng)研究的范圍擴(kuò)展到四種不同的地下哺乳動(dòng)物時(shí),更加令人震撼的發(fā)現(xiàn)出現(xiàn)了——盡管這些動(dòng)物生活在不同的大陸,屬于不同的動(dòng)物家族,進(jìn)化歷史相距甚遠(yuǎn),但它們?cè)诨驅(qū)用鎱s表現(xiàn)出了驚人的相似性。
研究人員發(fā)現(xiàn)了,有35個(gè)基因在這四種動(dòng)物中都發(fā)生了相同的變化。這就像是四個(gè)從未謀面的人,卻不約而同地選擇了相同的解決方案來(lái)應(yīng)對(duì)相同的問(wèn)題。
其中最引人注目的,是一個(gè)叫做Megf11的基因。這個(gè)基因負(fù)責(zé)眼部發(fā)育,在四種地下動(dòng)物中都發(fā)生了相同的變化:調(diào)控合成蛋白質(zhì)的某個(gè)氨基酸從丙氨酸被替換成了絲氨酸。
更有趣的是,當(dāng)科學(xué)家們擴(kuò)大調(diào)查范圍,查看了45種不同的嚙齒動(dòng)物后,發(fā)現(xiàn)這種變化不僅存在于地下動(dòng)物中,還出現(xiàn)在一些夜行性動(dòng)物身上。
這個(gè)發(fā)現(xiàn)意義深遠(yuǎn):不管是生活在地下的動(dòng)物,還是習(xí)慣夜間活動(dòng)的動(dòng)物,都面臨著相似的“黑暗挑戰(zhàn)”,而大自然則給出了相同的“標(biāo)準(zhǔn)答案”——通過(guò)改變Megf11基因來(lái)更好地適應(yīng)黑暗環(huán)境。
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一只生活在土耳其的土黃鼴形田鼠(圖片來(lái)源:維基百科)
Part.5
有舍才有得: Krt9基因“退休”讓爪子更靈活
更令人驚訝的發(fā)現(xiàn),來(lái)自對(duì)Krt9基因的研究。這個(gè)基因通常負(fù)責(zé)制造角蛋白9,這是一種能讓皮膚變硬的蛋白質(zhì)。但在所有四種地下哺乳動(dòng)物中,這個(gè)基因都“壞掉了”——科學(xué)家稱(chēng)之為“假基因化”。
乍一看,這似乎是件壞事。畢竟,基因“壞了”通常意味著功能缺失。但對(duì)于地下動(dòng)物來(lái)說(shuō),這可能反而是件好事。Krt9基因的產(chǎn)物主要在腳掌部位發(fā)揮作用,讓皮膚變得堅(jiān)硬。但對(duì)于需要長(zhǎng)期用爪子挖掘的地下動(dòng)物來(lái)說(shuō),過(guò)度堅(jiān)硬的皮膚可能會(huì)妨礙它們的挖掘效率——就好比過(guò)于厚實(shí)的裝甲反而讓坦克變得笨重。因此,“丟掉”這個(gè)基因可能讓它們的爪子變得更加靈活有力。
Krt9基因的失活并不是偶然現(xiàn)象,而是在至少八個(gè)不同的地下哺乳動(dòng)物家族中都獨(dú)立發(fā)生了。這強(qiáng)烈暗示,對(duì)于選擇地下生活的哺乳動(dòng)物來(lái)說(shuō),失去Krt9基因是一種普遍的適應(yīng)策略。
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一只生活在烏克蘭的盲鼴鼠(圖片來(lái)源:維基百科)
Part.6
沒(méi)有“外援”,全憑實(shí)力:微生物伙伴的“意外缺席”
在研究地下動(dòng)物的適應(yīng)機(jī)制時(shí),科學(xué)家們?cè)疽詾槟c道微生物也參與了這場(chǎng)適應(yīng)性演化的“大合唱”。畢竟,在我們已知的許多例子中,動(dòng)物都會(huì)借助腸道中的微生物伙伴來(lái)適應(yīng)特殊環(huán)境。
比如,生活在青藏高原的牦牛和綿羊,它們的腸道微生物組成非常相似,這些微生物幫助宿主更好地消化食物,適應(yīng)高海拔的低氧環(huán)境。還有專(zhuān)門(mén)吃螞蟻的動(dòng)物,如食蟻獸、土豚等,雖然分屬不同家族,但它們的腸道微生物也表現(xiàn)出相似性,特別是在消化螞蟻外殼中的幾丁質(zhì)方面。
然而,地下哺乳動(dòng)物卻給了研究人員一個(gè)意外。通過(guò)對(duì)包括中華竹鼠、長(zhǎng)尾鼩鼴在內(nèi)的多種地下動(dòng)物的腸道微生物分析,研究人員發(fā)現(xiàn),不同種類(lèi)的地下動(dòng)物擁有完全不同的腸道微生物群落。
原來(lái),這些地下動(dòng)物雖然都選擇了地下生活,但它們的食性、消化系統(tǒng)結(jié)構(gòu)以及進(jìn)化歷史都不相同。有些是食草動(dòng)物,有些是食蟲(chóng)動(dòng)物;有些有復(fù)雜的消化系統(tǒng),有些則比較簡(jiǎn)單。這些差異的影響可能比棲息環(huán)境的影響更大。
另外,與那些完全生活在高海拔或深海的動(dòng)物不同,地下動(dòng)物偶爾還會(huì)到地面上活動(dòng),因此地下環(huán)境的選擇壓力可能沒(méi)有其他極端環(huán)境那么強(qiáng)烈和持續(xù)。
Part.7
因勢(shì)而為:基因組主導(dǎo)的生存哲學(xué)
依靠改造自身基因組來(lái)適應(yīng)極端環(huán)境,而非依賴(lài)微生物伙伴的幫助,這便是地下哺乳動(dòng)物智慧的生存哲學(xué)
這種策略有其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。雖然基因改變需要很長(zhǎng)的演化時(shí)間,但一旦形成,就非常穩(wěn)定可靠。就像是給自己的身體安裝了一套永不會(huì)背叛的“內(nèi)置工具”,無(wú)論走到哪里,都能隨身攜帶。
相比之下,依賴(lài)微生物伙伴的策略雖然可能更加靈活,但也沒(méi)那么“靠譜”。微生物群落可能會(huì)因?yàn)轱嬍场h(huán)境或其他因素發(fā)生變化,從而影響宿主的適應(yīng)能力。
這種差異告訴我們,面對(duì)相似的環(huán)境挑戰(zhàn),不同的生物類(lèi)群可能會(huì)選擇截然不同的解決方案。有些選擇“內(nèi)功修煉”(基因改造),有些選擇“外援助力”(微生物合作),還有些可能兩者兼用。每種策略都有其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)和適用條件。
Part.8
智慧延伸:自然界工程師對(duì)人類(lèi)的啟示
地下哺乳動(dòng)物就像是自然界的“地下工程師”。它們不僅為自己設(shè)計(jì)了完美的地下生存裝備,還在生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮著重要作用:它們的挖掘活動(dòng)就像天然的“犁田機(jī)”,不斷翻松土壤,改變地貌,促進(jìn)植物生長(zhǎng)和生態(tài)系統(tǒng)的更新;它們還是土壤中碳循環(huán)和營(yíng)養(yǎng)循環(huán)的重要參與者,對(duì)維持地下生態(tài)系統(tǒng)的健康具有不可替代的作用。
對(duì)于人類(lèi)來(lái)說(shuō),地下哺乳動(dòng)物的適應(yīng)機(jī)制也提供了寶貴的啟示。比如,它們應(yīng)對(duì)缺氧環(huán)境的分子機(jī)制,可能為治療心腦血管疾病提供新思路;它們長(zhǎng)期生活在多是病菌的土壤里,卻很少生病,這種獨(dú)特的免疫調(diào)節(jié)方式可能啟發(fā)新的免疫治療方法;特別是裸鼴鼠的長(zhǎng)壽特征,更是抗衰老研究的熱點(diǎn),或許未來(lái)從這里,我們能找到延緩人類(lèi)衰老的秘密。
更重要的是,這項(xiàng)研究展示了現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)的強(qiáng)大威力。通過(guò)基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)等多種技術(shù)的結(jié)合,科學(xué)家們終于能夠深入到分子層面,理解這些神奇適應(yīng)現(xiàn)象背后的機(jī)制。這不僅滿足了人類(lèi)的好奇心,也為未來(lái)的應(yīng)用研究奠定了基礎(chǔ)。
這項(xiàng)研究讓我們看到了生命適應(yīng)極端環(huán)境的多樣性和自然界中蘊(yùn)藏著的無(wú)窮智慧。隨著環(huán)境變化日益加劇,理解這些適應(yīng)機(jī)制不僅有助于保護(hù)生物多樣性,也可能為人類(lèi)應(yīng)對(duì)未來(lái)挑戰(zhàn)提供靈感。
參考文獻(xiàn):
[1]Li, Kexin, et al. "Host genomic convergence, rather than gut microbiome convergence, underlies the convergent evolution of subterranean adaptation in mammals." Cell Reports 44.8 (2025).
出品:科普中國(guó)
作者:郭菲
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