當我們把一顆種子埋在土壤中,它在黑暗中萌發(fā),長出細長的黃化幼苗。而一旦接觸到陽光,幼苗就會立刻停止伸長,葉片迅速轉(zhuǎn)綠——這一神奇的生命轉(zhuǎn)換背后,隱藏著植物感知和傳遞光線密碼的精密分子機制。
近日,中國科學院華南植物園劉勛成研究員團隊首次揭示了一種名為“乙酰化”的蛋白質(zhì)修飾方式在幼苗從“破土” 到“見光生長”過程中的核心調(diào)控作用。該成果近日發(fā)表于國際學術(shù)期刊《分子植物》(Molecular Plant)。
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(圖片來源:作者使用AI生成)
幼苗從黑暗到照光后的劇變:蛋白質(zhì)“去乙酰化”大爆發(fā)
種子植物一生中最重要的轉(zhuǎn)變之一,就是從黑暗中的“黃化生長”(skotomorphogenesis)轉(zhuǎn)向光照下的“光形態(tài)建成”(photomorphogenesis)。這一過程涉及成千上萬蛋白質(zhì)的精密調(diào)控。賴氨酸乙酰化修飾(Lys-Ac)作為一種進化上保守而重要的蛋白質(zhì)修飾方式,這種修飾方式可以改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、穩(wěn)定性和功能,在植物發(fā)育中扮演著關(guān)鍵角色。然而,它在幼苗“脫黃化”過程中的具體功能,一直是個未解之謎。
該團體以模式植物擬南芥(一種生長周期短,個體小,且易于遺傳轉(zhuǎn)化的植物材料)為研究對象,創(chuàng)新性地對幼苗進行了光照前后的全蛋白質(zhì)組乙酰化修飾分析。結(jié)果令人驚訝:當黑暗中的幼苗接觸到光后,蛋白質(zhì)的賴氨酸乙酰化修飾呈現(xiàn)大面積減少——這提示著“去乙酰化”過程在光信號傳導中扮演關(guān)鍵角色。
光受體phyA動態(tài)乙酰化變化:一個關(guān)鍵的分子開關(guān)被發(fā)現(xiàn)
在植物從黑暗環(huán)境轉(zhuǎn)向光照的過程中,光受體蛋白扮演著至關(guān)重要的角色。本研究就聚焦于植物重要的光受體——光敏色素A(phyA)。團隊在早期研究中,通過最前沿的高通量蛋白質(zhì)乙酰化組學實驗,比較了黑暗生長的擬南芥幼苗與出土見光生長3小時后的幼苗中發(fā)生乙酰化修飾變化的蛋白質(zhì)和位點。發(fā)現(xiàn)當黃化幼苗見光后,phyA蛋白第65位的賴氨酸(K65)會發(fā)生特異性去乙酰化修飾。
更關(guān)鍵的是,這個位點正是調(diào)控phyA穩(wěn)定性的“分子開關(guān)”:K65去乙酰化直接促進phyA的泛素化修飾(一種蛋白質(zhì)修飾方式,通常作為蛋白質(zhì)降解的標記物);泛素化標記進而引導phyA被26S蛋白酶體降解。這一降解過程對phyA行使光信號傳導功能至關(guān)重要。這是因為,作為光的信使,phyA蛋白在傳遞完光信號的幾個小時內(nèi),必須要盡快的降解,從而避免過度的生化作用抑制幼苗的發(fā)育。
鎖定關(guān)鍵調(diào)控因子:植物特有的HDT2
我們進一步追蹤發(fā)現(xiàn),一種植物特有的去乙酰化酶HDT2,正是操控這一過程的關(guān)鍵因子。
通過蛋白質(zhì)互作分析技術(shù),如蛋白質(zhì)復合體分析、雙分子熒光互補以及免疫共沉淀等實驗,我們發(fā)現(xiàn)HDT2在細胞核內(nèi)與phyA直接相互作用,并特異性催化phyA的K65位點去乙酰化,促進phyA的泛素化修飾與蛋白質(zhì)的快速降解。
我們還開展了遺傳學實驗對此進行證實,結(jié)果顯示,HDT2缺失突變體在遠紅光下表現(xiàn)出明顯的光形態(tài)建成缺陷,充分說明該酶在phyA介導的光信號通路中的核心地位。
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圖注:野生型和HDT2缺失突變體幼苗在遠紅光下的生長表型
(圖片來源:參考文獻[1])
科學意義:揭示光控植物發(fā)育新機制
這項研究具有重要的科學意義,首次揭示出光觸發(fā)蛋白質(zhì)大規(guī)模去乙酰化是幼苗脫黃化的關(guān)鍵事件,其中光受體phyA通過其K65位點的特異性去乙酰化實現(xiàn)自身降解調(diào)控。值得注意的是,研究還鑒定出植物特有酶HDT2是光信號與蛋白質(zhì)修飾的橋梁,這一發(fā)現(xiàn)為理解植物光形態(tài)建成的分子機制提供了全新視角。
“這項工作揭示了賴氨酸去乙酰化修飾在植物光形態(tài)建成中的核心地位,”劉勛成研究員表示,“它首次證明蛋白質(zhì)乙酰化修飾直接調(diào)控光受體的穩(wěn)定性,為理解植物光信號轉(zhuǎn)導開辟了新維度。”
這項基礎(chǔ)研究的突破,不僅加深了對植物光感知機制的認知,也為未來通過分子設(shè)計調(diào)控作物幼苗生長提供了新的理論靶點。
結(jié)語
當種子破土而出,幼苗迎接第一縷陽光時,一場由HDT2精密調(diào)控的蛋白質(zhì)去乙酰化風暴正在細胞核內(nèi)上演——正是這些納米尺度的分子事件,決定了植物生命的綠色轉(zhuǎn)型,也成為植物開啟光合生命的第一個重要轉(zhuǎn)折點。從黑暗到光明,從依賴到自養(yǎng),這場微觀世界的分子風暴,最終推動了植物王國至關(guān)重要的生存轉(zhuǎn)型。
參考文獻:
[1]Zheng, Feng, et al.“HDT2-mediated lysine deacetylation promotes phytochrome A degradation during photomorphogenesis in Arabidopsis.”Molecular Plant (2025).
出品:科普中國
作者:劉勛成(中國科學院華南植物園)
監(jiān)制:中國科普博覽
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